jueves, 23 de mayo de 2019

Pruebas de detección molecular para la Malaria

MICROARRAYS EMPLEADOS PARA LA DETECCIÓN DE LA MALARIA

Los microarrays de ADN son una herramienta poderosa para el análisis de la composición de ARN y ADN a escala del genoma completo.
Resultado de imagen para microarrays malaria
Esta revisión examina los diversos enfoques para el análisis de la transcripción de Plasmodium que se están adoptando mediante el análisis de micromatrices de ADN y analiza estrategias adicionales para obtener y recopilar información relevante para la búsqueda de fármacos y vacunas candidatas en la malaria.

Microarrays de ADN (construidos a partir de pre-sintetizados ADN) y chips de ADN (que involucran ADN in situ síntesis usando química dirigida a la luz)

Microarrays aleatorios (escopeta) P. falciparum  

Estos se han construido a partir de una biblioteca genómica (gDNA) digerida con nucleasa de mung-frijol, usando cebadores universales para flanquear la secuencia de vectores y reacción en cadena de la polimerasa (PCR) amplificación de Inserciones de ADNg.

Esto reduce los 30 Mb. genoma de P. falciparum a ~ 6000 genes ya sea como ORFs o exones enteros.

Microarrays genéticamente específicos

Estos se están desarrollando actualmente a partir de grandes conjuntos de la etiqueta de secuencia génica bien caracterizada (GST).

Tiene la ventaja de comenzar con lo conocido secuencias La representación de los genómicos secuencias podrían estar sesgadas en secuencias EST.


Bibliografía:

http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/download?doi=10.1.1.478.3764&rep=rep1&type=pdf
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11850013

domingo, 19 de mayo de 2019

Detección de la enfermedad por PCR en tiempo real

T: Uso de la región 18 ribosomal para la identificación de las 4 especies del plasmodium.
Plasmodium y sus cepas por uso de PCR anidad indicando conseervación polimórfica dentro de la secuencia génica.

O: Verificar la enfermedad en el Gen 18rRNA

M: sangre


G:  Plasmodiumsp     .RPLU5      1.100 pb


P. falciparum             RFAL1        205 pb
                                  .RPLU5
                                   RFAL1

P. vivaxr                     VIV1           120 pb
                                   VIV2


P. ovale                      ROVA1        800 pb
                                   ROVA2

P. malariaer               MAL1          144  pb
                                   MAL2

A: ADN Genómico

PCR: PCR anidada

Pasos:   D       94°C; 4"
             M       58°C; 2''-----------> 25 Ciclos
             E        72°C;  2''

V: EFO

Bibliografía: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1393165/